农村信用社会计科目的账务处理主要如下：

一、发放贷款：

代理社：

借：贷款类科目，

贷：活期存款—企业户，

成员社：

借：贷款类科目，

贷：存放联社款项，

代理社收到划来的款项后：

借：联社存放款项，

贷：活期存款—企业户，

二、收回贷款本金及利息：

代理社：

借：活期存款—企业户，

贷：贷款科目利息收入联社存放款项，

成员社：

借：存放联社款项，

贷：贷款科目利息收入，

贷款发生逾期占用形态发生改变按相应办法结转。

以上假设条件：代理社为联社营业部，且各信用社在营业部开设结算账户，科目使用1124存放联社款项和2323联社存放款项。